El territorio del Cauca fue analizado para su planificación regional a nivel departamental, teniendo en cuenta la integración de 3 Estructuras Territoriales fundamentales para entender el modelo de ocupación de las comunidades en el territorio.

Estas estructuras se denominaron: Estructura Biofísica- Ambiental, Estructura Socioeconómica y Espacial, y Estructura Funcional y de Servicios. La estructura Biofísica-Ambiental se compone principalmente por la Estructura Ecológica Principal, cuya representación cartográfica es presentada en este primer Piloto de la IDE Cauca, Ya que al igual que la Estructura Socioeconómica y Espacial, fueron priorizadas por su importancia y relación con las entidades y dependencias que lideran este proyecto.